实验中心实行校、院两级管理体制，学校负责总体规划与建设，学校任命管理能力强，学术水平高、教学科研实践经验丰富的胡青龙教授为中心主任。另配副主任，实行主任负责制，下设中心办公室。实验室的教师和技术人员由学院进行统一管理，中心负责考核聘用。为规范管理，中心制定了《实验室管理制度》、《实验指导教师岗位职责》、《实验技术人员岗位职责》等规章制度。

（1）仪器设备管理制度

学校制定了《西昌学院设备管理工作规定》、《西昌学院精密贵重仪器和大型设备管理办法》等系列仪器设备管理制度。根据《西昌学院精密贵重仪器和大型设备管理办法》规定大精仪器设备（10万元以上）的管理实行主管校长领导下的学校、二级学院两级管理体制。学校国有资产管理处是学校一级管理机构，实验中心为二级管理机构。对大精仪器设备进行专人管理，建立了完整的技术档案。中心结合自身实际情况，制订了一系列措施，使设备管理实现制度化、规范化、标准化和信息化。规定实验室设备的维修和保养由实验室技术人员承担，要求仪器操作教师和实验室工作人员使用前检查仪器的完好状况，实验完毕清理仪器，进行定期保养，并做好仪器的使用记录。

（2）设备建档

对于大型仪器设备，从其考察、招标、签订合同、购置、调试安装，到形成教学和生产能力进行全过程纪录，建立设备卷宗，全程记录大精设备运行使用、维护检修、改造更新直至报废等整个寿命周期的原始数据。

（3）专人负责

设专职人员对仪器设备的保管、借用、调拨、报损、报失、报废、维护保养和检修等进行管理，保证仪器设备的正常运行，管理人必须认真填写国资处下发的设备履历本和使用记录本，仪器故障进行专业维修，严禁私自拆卸。大型、精密仪器均由专人保管，定期维护，由于中心维护措施得力，目前仪器的完好率在92%以上。

（4）经费保障

实验中心设备维护维修经费主要有两个来源：一是学校设立的仪器维修基金和大型贵重仪器设备专项维修基金，维修经费由学校纳入年度预算。二是中心自筹经费（包括纵向、横向等科研项目）设立的仪器设备专项维修基金。充足的经费确保了各项工作的顺利开展。