信息技术学院历史沿革追溯到西昌农业高等专科学校的工程技术系。
1994年,西昌农业高等专科学校工程技术系开办计算机应用技术专科专业;
2000年,计算机应用技术专科专业从工程技术系独立出来,成立信息技术系,并于2001年开办应用电子技术专科专业;
2002年,信息技术系与西华大学数理与计算机系联合开办计算机科学与技术本科专业;
2003年,西昌学院成立,西昌师范高等专科学校的计算机教育系的教师和相关专业并入信息技术系,并独立设置计算机科学与技术本科专业并招生,该专业2007年获学士学位授予权,2010通过本科合格评估。并于2005年开办电子信息工程本科专业,该专业于2008年获学士学位授予权,2010通过本科合格评估;
2009年,西昌学院成立二级学院,将信息技术系和数理系进行合并成立汽车与电子工程学院,并入电子科学与技术本科专业,该专业于2008年开设,2012年获学士学位授予权;
2017年,西昌学院根据规划和发展的需要,进行专业布局和调整,成立信息技术学院。
学院现开设有计算机科学与技术、电子信息工程、电子科学与技术三个本科专业,同时,承担了全校《大学公共计算机基础》课程教学任务。